Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSEQ9UL01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSEQ9UL01 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSEQ9UL01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms