Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms