Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms