Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP4Q9UKK3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms