Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAG3Q9UJ98 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms