Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSRAQ9UJ68 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms