Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFMBT1Q9UHJ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms