Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms