Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms