Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms