Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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