Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms