Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms