Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP39A1Q9NYL5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP39A1Q9NYL5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP39A1Q9NYL5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP39A1Q9NYL5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP39A1Q9NYL5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP39A1Q9NYL5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP39A1Q9NYL5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms