Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms