Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A2Q9NTI2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A2Q9NTI2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A2Q9NTI2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A2Q9NTI2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A2Q9NTI2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A2Q9NTI2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A2Q9NTI2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms