Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms