Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELLSQ9NRZ9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms