Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC1Q9NRX5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms