Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms