Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOPCQ9HD26 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOPCQ9HD26 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms