Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms