Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms