Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms