Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB1BQ9H0U4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB1BQ9H0U4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms