Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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