Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms