Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms