Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT23Q9C075 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms