Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms