Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPOQ9BU64 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPOQ9BU64 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms