Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms