Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms