Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms