Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIKE1Q9BRV8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms