Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MESP1Q9BRJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms