Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms