Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms