Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms