Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC5LQ99459 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC5LQ99459 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms