Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP2Q96SN8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms