Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms