Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms