Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms