Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC11Q96J66 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms