Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms