Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM43Q96BQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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