Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms