Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM52Q96A61 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM52Q96A61 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms