Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKD1Q969G9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms